Sūklis Bobs kopā ar savu labāko draugu Patriku dodies okeāna dzīlēs, kur neviens sūklis vēl nav spēris kāju. Tur viņus gaida noslēpumainā pirātu spoka - Lidojošā holandieša sagatavotie izaicinājumi un pārbaudījumi, un okeāna dzīļu mistērijas. Pirms filmas - īsfilma "Bruņurupuči nindzjas: Pazuduši Ņūdžersijā".